Description

Le projet shapeNread vise à optimiser la structure tridimensionnelle de polymères synthétiques encodés pour permettre leur séquençage à haut débit en couplant la spectrométrie de masse en tandem à la spectrométrie de mobilité ionique. Ces polymères seront synthétisés de sorte à segmenter les informations binaires qu’ils contiennent. Les segments seront décorés par un marqueur spécifique afin de les distinguer en termes de masse et de conformation. Pour ce faire, les marqueurs seront conçus par modélisation moléculaire pour conférer aux segments des sections efficaces de collision distinctes. Une fois libérés de la chaîne polymérique lors d’une première étape de fragmentation, ces segments pourront alors être séparés par mobilité ionique pour séquençage individuel après une seconde étape de fragmentation. Un tel design permettra la lecture haut débit par MS/MS-IMS-MS/MS de l’information codée dans des macromolécules contenant chacune au moins un décabyte de données. Un développement spécifique du logiciel MS-DECODER assurera une analyse automatisée des données spectrales.

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